1中国农业科学院烟草研究所, 烟草遗传改良与生物技术重点开放实验室, 青岛, 266101;
2中国农业科学院研究生院, 北京, 100081; 3青岛市农业科学研究院, 青岛, 266100
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14 卷, 第 7 篇
收稿日期: 2015年09月08日 接受日期: 2015年09月15日 发表日期: 2016年01月10日
2中国农业科学院研究生院, 北京, 100081; 3青岛市农业科学研究院, 青岛, 266100
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14 卷, 第 7 篇
收稿日期: 2015年09月08日 接受日期: 2015年09月15日 发表日期: 2016年01月10日
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摘要
随着分子群体遗传学的快速发展和SSR标记的广泛应用,一些分子群体遗传学分析软件相继问世。但是不同软件的SSR数据输入文件格式并不一致,人工转换费时费力,且易出错。因此,本研究利用Python高级计算机语言开发了SSR分子标记数据格式转换软件DataFormater。该软件具有友好的图形用户界面,能高效准确的把SSR原始数据快速转换为Popgene、Ntsys、PowerMarker、Structure、Tassel、SPAGeDi等常用分子群体遗传学分析软件的输入文件,同时还具过滤稀有等位、过滤无多态位点、用户数据校验等功能。与人工转换相比,DataFormater可大大提高转换的效率和准确性。因此,DataFormater将是分子群体遗传学研究中不可或缺的工具软件。现在用户可以通过DataFormater软件的主页进行下载,网址为:www.ycsjk.com.cn/dataformater/home/,或通过电子邮件renmin@caas.cn索取该软件。
关键词
分子群体遗传学;分子标记;SSR;数据格式,软件;Python计算机语言
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